醫院污水水質類似于生活污水，但成份復雜。如消毒劑，來自化驗、檢驗、手術等各科室的重金屬、有機試劑，以及可能的放射性同位素等。作為醫院，其排放的污水中含有大量有毒化學物質和多種致病菌、病毒和寄生蟲卵。它們在環境中具有一定的適應能力，有的甚至在污水中存活時間較長，若未處理或處理不當即排入水體或用于灌溉，將會污染環境，影響人們的身體健康。參考同類廢水，其指標如下：
名稱 | CODcr（mg/L） | BOD5（mg/L） | SS（mg/L） | 氨（mg/L） | 大腸桿菌（個 /L） |
廢水含量 | 150～300 | 80～150 | 40～120 | 10～50 | 1.0×106~3.0×108 |
平均值 | 250 | 100 | 80 | 30 | 1.6×108 |
醫院廢水經過格柵攔截，去除大塊漂浮物和顆粒物質后，出水自流入調節池，均衡水質水量，出水經過污水泵抽入A級生物池，A級生物池內廢水在厭氧菌作用下，大分子有機物被分解成為小分子有機物，提高廢水的可生化性，減小后續好氧處理運行負荷；出水自流入O級生物池，好氧微生物利用水中的有機污染物為底物進行好氧代謝，使有機物以低能位的無機物穩定下來，達到無害化的過程，出水自流入二沉池，利用重力作用進行泥水分離，出水自流入消毒池，投加二氧化氯，進行消毒，經過消毒后的污水，直接達標排放。
